机械设计制造及其自动化专业是在1958年成立的青海省工学院机械制造工艺及装备专业的基础之上发展起来的；在面向全国、服务地方的政策指导下，为了适应地方经济建设发展对机电复合型专业技术人才的需求，1999年将原有的机械制造工艺与设备与机械电子工程归并为机械设计制造及其自动化专业。2022年06月获批国家一流本科专业，本专业重点研究机械装备在极端环境下的加工、制造、运维性能优化。结合中国制造2025要求，开展面向盐湖、化工、新能源、冶金、特色手工业及农产品加工等青海省优势产业需求的智能制造技术。在青海省内保持着“材料加工”、“先进医疗机器人技术”、“数控机床关键技术”、“数字化设计与制造”“智能农机装备”等关键领域的优势地位。